在上呈皇帝的一份奏折里,班超尽量以自己在西方的所见所闻为依据劝服朝廷出兵讨伐蛮族。他认为文人们菲薄远征是不对的,墨客们认为远征无用也是不客观的,只有出兵保护边疆才是最好的办法,才能使中国领土不再定期地受到匈奴人的侵袭,正所谓&ldo;三十六国(中亚细亚),号为断匈奴右臂&rdo;。他的这一策略,在奏折内概括成一个著名的成语&ldo;以夷制夷&rdo;。事实上,他之所以能够成功征服塔里木盆地,是因为他从每一块新征服的土地上及时补充了新兵,以便去征服其他正在叛乱的绿洲。至于从中国来的军队,只不过是由一小群冒险分子或充军之人组成,他们来到边疆过动荡生活只是为了恢复个人的名誉。他们生活在这里,并且尽自己的努力保护这里的安宁,以防匈奴游牧民族卷土重来。班超进一步解释说:&ldo;莎车、疏勒,田地肥广,草木饶衍……兵可不费中易进犯。80年、87年,他两次粉碎喀什的叛乱。88年,他平息了叶尔羌人的叛乱,并与伊犁的乌孙人结盟。班超屡次派出探子打探蛮族的情况,逐渐对&ldo;胡人&rdo;的心理了如指掌,于是他出击不再那么谨慎小心,而是放心大胆地与敌人周旋。喀什的国王忠,原本是接受他保护和支持的,却于84年联合了叶尔羌人、索格底安那人、月氏人发动了叛乱。87年,喀什国王被班超驱走后,装作愿意投降的样子要求拜见班超,而暗地里却带领一队骑兵想趁机突袭。班超看出了他的意图后非但没有降罪于他,反而设宴款待他。等到酒过三巡、菜过五味之后,将他们一网打尽,并砍下了忠的头。对于叶尔羌的叛乱,班超于88年率领少数的汉兵以及在于阗招募的兵丁前往出击,当时叶尔羌人得到了库车人及邻近城市五万人的帮助。班超寡不敌众,佯作战败,深夜撤退之后又带兵急回,于&ldo;鸡鸣时&rdo;奔赴叶尔羌营,斩敌5000人,迫使其投降。
库车与喀喇沙尔看到叛乱局面不能持久,就开始四处活动,从蒙古的匈奴到月氏与印度-塞人中寻求联盟来抵抗中国。90年,印度-塞人国王,即统治阿富汗与印度西北部的强大的贵霜王朝皇帝(大概是伽迪腓斯一世),因为不曾娶到一个中国公主为妻而心怀不满。于是,他派了一支远征军来到帕米尔东北,帮助库车反抗班超。班超将这支远征军与库车人间的交通运输线全部截断,远征军失去了粮草的供给,只能冒险行进在喀什噶尔地区遥远而又荒凉的小道上。结果他们不战而退。90年,贵霜王朝在接受了这次危险教训之后,又一次采取了月氏人传统的同中国友好的政策。
89~90年,在蒙古境内,窦宪与耿秉将军也在征讨北匈奴的战役中获得了一次大的胜利。后车师(古城)与前车师(吐鲁番)的两个国王又与中国恢复了联系。公元91年,中国将军耿夔又一次给匈奴以沉重的打击。耿夔一直推进到外蒙古,应该是到了鄂尔浑河,捕获了单于的母亲和所有的随从,并且另立单于的弟弟于除为王。93年,匈奴新单于又一次反叛,中国令东北边境的蒙古游牧部落攻打他们,获胜并一举杀掉了新单于。此次胜利给了北匈奴致命的一击,使得他们再也没有能够复兴起来。
91年,由于失去匈奴与印度-塞人的援助,塔里木盆地北部的四个反叛城市中的三个‐‐库车、阿克苏和乌什-叶鲁番都向班超臣服。班超作为征服西域的功臣被朝廷封为&ldo;西域都护&rdo;,相当于中亚细亚的总督,在库车附近的乾城建立了都护府。另外还有一个中国将军驻扎在喀什。现只剩下喀喇沙尔还没有平定。94年,班超又率领库车与鄯善(罗布泊地区)的土著兵马前去夺取这个叛乱的城市。喀喇沙尔人急忙将裕勒都斯河上的桥拆掉,但也无济于事,虽然水深齐腰,但班超仍然带兵赤足渡河,最终在喀喇沙尔城前的泥沼中出现。当时,国王投降,部分居民逃入巴合剌什湖(博斯腾湖)。班超为了给19年前在此地被杀害的中国都护陈睦报仇,将国王斩首。班超&ldo;因纵兵钞掠,斩首五千级,获生口万五千人,马畜牛羊三十余万头&rdo;。塔里木盆地终于被全部平定了。97年,班超命副将甘英经安息国(即安息王朝统治下的帕提亚帝国)去大秦(罗马帝国)。但这位中国使者被帕提亚人的谎言骗住,没有越过帕提亚人的领地,就在半途返回了,并没有到达罗马帝国的边界。
公元102年,班超告老还乡,同年病逝。这个伟大将军的后继者们没有能力仿效他统治蛮夷的有效政策。于是,106年、107年发生了两次大规模的叛乱。中国将军梁槿在塔里木盆地的库车附近被围困,历尽千辛万苦才得以解围。但此时的中国朝廷已无心应对这连年的叛乱,于公元107年命令所有在塔里木盆地,甚至在柳中与伊吾的戍边官兵一律班师回朝。次年,又有一股游牧于青海湖以西及以南的蛮族势力(羌人)入侵甘肃的中国要塞,如果不加阻拦,就有可能被截断通往敦煌的道路。108年,梁槿英勇抵抗,与敌人周旋,不惜一切代价地保护要塞。109年,内蒙古的南匈奴人又骚扰中国边境。中国度辽将军耿夔鼓动鲜卑族游牧部落起来对付他们,但是他们仍然没有放弃对山西北部骚扰,迫使梁槿与他们的单于讲和(110年)。
总之,中国一直在艰苦地捍卫着自己本土的边界。到了119年开始复兴,重新建立了伊吾(哈密或罗布罗布泊)的军屯区,鄯善与吐鲁番国王再次投降。但不久,北匈奴单于与后车师(古城)突然叛变,杀害了中国在伊吾的屯兵。后来班超的儿子班勇子承父业,于123年在吐鲁番附近的柳中重建军屯区。124年,他奖励了鄯善国王对中国的忠诚,迫使库车国与阿克苏国王子们向他投降,并用这两个国家的兵卒驱逐了吐鲁番的匈奴人。126年,他降服了居住在巴里坤东北的匈奴呼衍部,并将企图进行干涉的北匈奴军队驱逐出境。127年,中国人进入喀喇沙尔,完成了对塔里木盆地的再次征服。130年,喀什王的儿子与费尔干纳国王的使臣来到中国的首都,朝拜中国皇帝。