任命陆军部长贝尔蒂埃将军为预备军团总司令。卡尔诺[注:卡尔诺(1758-1823),原是一位很有能力的工兵军官,曾为五位督政官之一,果月十八政变(1797年9月4日)后被放逐。1799年12月,他获准回到了法国。]继任陆军部长。
这样,拿破仑就规避了新宪法对其军事行动的限制,并通过任命自己的亲信为名义上的司令而智胜了他的政治对手。事实证明,这次司令职务的移交是一场彻头彻尾的滑稽剧。
按照拿破仑的原定计划(该计划已于3月22日通知贝尔蒂埃),预备军团应自日内瓦湖上溯罗纳河上游谷地,穿过圣戈塔德山口,再取道马乔列湖进入伦巴第平原(这与俄将苏沃洛夫1799年的那次行动路线正好方向相反)。然而,过了一周他就修订了这个计划,把圣戈塔德山口划给莱茵军团。
4月6日,预备军团新任司令贝尔蒂埃命令参谋长杜邦将军[注:杜邦(1765-1840),是一位有能力的军官,但1808年7月当他在西班牙指挥一个军时,不幸被西班牙人所围并被迫作有条件的投降。]在第戎建立预备军团司令部,他自己则前往巴塞尔与莱茵军团司令莫罗会晤,以便协调在未来的攻势作战中各自的行动。指挥莱茵军团右翼的蒙塞奉命率一个师穿越圣戈塔德山口,与米兰附近的预备军团会师。与此同时,莱茵军团的余部则入侵黑森林并在那里与克赖将军指挥的奥军交战。
4月18日,贝尔蒂埃从巴塞尔返回第戎,总揽了预备军团的指挥权。拿破仑早已在那里集结了三万二千人,组成了四个师分别由包德、沙布南、罗森和华亭指挥,而以缪拉指挥的骑兵师为核心。各部队都缺乏武器装备和运输工具并且都在成批招幕新兵以补充兵力。原来设想,预备军团兵力多达五万人,但当时却不能给这样规模的一支军队提供足够的马匹和装备。第一执政,有碍于宪法不允许他亲自指挥军队,现在简直象一位编外总军需主任通过卡尔诺向贝尔蒂埃下达一连串命令以纠正编组上的差错。
作战计划的一个要点是选择预备军团翻越阿尔卑斯山的的路线。拿破仑急于行动愈早愈好,以便收到奇袭的效果。但当时仍大雪封山,阿尔卑斯山各山口均无法通过。拿破仑本人所刻意仿效的汉尼拔曾于公元前218年九、十月间越过地势较低的柯亭阿尔卑斯山,那时积雪已大部分融化。但是越过柯亭阿尔卑斯山只能威胁梅拉斯的右翼,而拿破仑的计划却是要攻击他的后方。因此,他必须在勃朗峰以东的某处越过阿尔卑斯山的主峰。这样,要使炮兵得以通过,他就只有两个山口可供选择:一个是大圣伯纳德山口(8,110英尺),另一个是辛普朗山口(6,590英尺),因为圣戈塔德(6,935英尺)已经划给莱茵军团的右翼了。三月间,第一执政派了一名参谋军官去侦察这两个山口。他回来汇报说,尽管辛普朗山口较低,但大圣伯纳德山口还是容易通行一些,因为该山口难行地段仅六英里左右,而辛普朗山口难行地段却长得多。于是拿破仑便决定走大圣伯纳德山口,这条路可直达都灵,而且从第戎基地出发,行军距离也较短。那位参谋军官还建议,如果把火炮装在特制的雪橇上,就有可能把这些炮都运过山口。拿破仑下令在巴黎制造十部装有滚轮的载炮雪橇,另一批则在奥松火炮工场制造。
作战的第一阶段是要把全军向南移动一百二十英里到达日内瓦湖附近一个新的集结地域。然后再由那里沿日内瓦湖北岸行军五十六英里经洛桑到远端的维尔纳夫,辎重等军需品则用船从日内瓦运往维尔纳夫。独立的日内瓦共和国已于两年前被法国强行兼并,变成了法国的莱芒行政区。同时,十三个中立的瑞士州也被占领并被合并成了法国的一个卫星国,称做黑尔维谢共和国。因此,第一执政在瑞士境内可以为所欲为。
当预备军团还在第戎集结时,第一执政的计划就被奥军采取的一个意想不到的主动行动所打乱。
4月5日,梅拉斯以六万兵力向马塞纳的意大利军团突然发动进攻,而马塞纳当时只据守着热那亚以北利古里亚亚平宁山山脊。马塞纳虽然受到两倍于己的奥军进攻,仍英勇抗击,但由于其兵力已被一分为二,其右翼(一万七千人)由苏尔特指挥,已被逐回热那亚防线以内,其左翼(一万一千人)由絮歇指挥被压向了西边的尼斯。马塞纳虽发起一连串坚决的反冲击,但仍未能突破热那亚防线,在那里,陆上有奥特将军所率的奥军;海上则有基思勋爵指挥的一个英国海军中队,因此,他始终受到严密的封锁。五月初,另一支奥军在艾尔斯尼兹的指挥下把絮歇逐过了瓦尔河并攻占了马塞纳的基地尼斯。而梅拉斯在皮埃蒙特仍握有一个军的预备兵力即凯门指挥的三万五千人。
这一不受欢迎的消息从热那亚前线传来使第一执政深为不安。4月24日,他给陆军部长卡尔诺下达了下述紧急指示:
意大利军团正与奥军奋力拼搏。无论是输是赢,预备军团都必须立即行动。如果我意大利军团获胜,那末奥军势必受到相当的削弱而无力抗击我预备军团;而如果我意大利军团失利,那末我预备军团进攻皮埃蒙特或伦巴第以分散敌方兵力仍然是至关重要的。……因此,我请您命令贝尔蒂埃将军:
1将预备军团向日内瓦推进,越快越好;
2把在日内瓦搜集的一切弹药给养由水路运往维尔纳夫;