处理完外交领域的事务的当天,拿破仑就要求贝尔蒂埃命令五个独立骑兵师(二万一千人)向莱茵河平行开进,扼守该河从纽夫布里沙赫到斯特拉斯堡之间的渡口。这些师将构成大军团的前卫。次日,他派其妹夫缪拉亲王,以&ldo;包尔蒙&rdo;上校的假名,对巴拉丁纳、巴伐利亚和黑森林作一次快速侦察,并就道路状况和河川的宽度提出报告。缪拉拟于9月11日回到斯特拉斯堡,届时,他将暂行代理大军团总指挥,皇帝到达后再统领骑兵军。
拿破仑的工程兵高级军官贝特朗将军也被派往上述地区,对那里的一切桥梁、渡口以及徒涉场作更详细的侦察,特别注意了解多瑙河、因河、莱希河和伊萨尔河河岸的性质。皇帝的另一名亲信参谋萨瓦里将军则被派往符腾堡境内作类似的侦察。拿破仑指示贝尔蒂埃准备一种标示奥军各个部队及其最近所处位置的卡片索引,以便皇帝能逐日查看奥军的战斗序列。贝尔蒂埃在拿破仑尚未进军校之前就已经是一位训练有素的参谋军官,但这项命令典型地表明皇帝对参谋工作的每个细节都是关注的。
8月26日,拿破仑指示贝尔蒂埃向大军团下达进军令。最北面的那个军是贝尔纳多特的第一军,当时正占据着汉诺威,他奉命9月2日出发,9月9日到达哥廷根;马尔蒙的第二军从布鲁日出发,定于9月15日到达美因茨。然后两军均进至巴拉丁纳的维尔茨堡。在那里,他们将与符雷德将军指挥的巴伐利亚部队会合。第三、四、五、六军8月27日出发,定于9月26日,到达斯特拉斯堡和曼海姆之间八十英里正面上莱茵河各渡口。奥热罗的第七军在布勒斯特,因此,其行程也最远。他奉命在纽夫布里沙赫渡过莱茵河,占领弗赖堡地区以便封锁黑森林的出口。
大军团从海峡沿岸到莱茵河边的行军,全程三百七十五英里,是历史上伟大的战略机动之一。它使人想起一个世纪前,马尔波罗由低地国家到多瑙河的进军,但拿破仑的兵力是马尔波罗的九倍。最后的进军令是8月29日从皇帝大本营发出的。当时,大军团是这样编成的:
第一军(贝尔纳多特),2个步兵师(每师9个营),1个轻骑兵师,15,000人;
第二军(马尔蒙),3个步兵师,1个轻骑兵师,20,000人;
第三军(达武),3个步兵师,1个轻骑兵师,25,000人;
第四军(苏尔特),3个步兵师,1个轻骑兵师,28,000人;
第五军(拉纳),3个步兵师,1个轻骑兵师,26,000人;
第六军(内伊),3个步兵师,1个轻骑兵师,21,000人;
第七军(奥热罗),2个步兵师,14,000人;
近卫军(贝西埃尔),1个步兵师,2个骑兵团,6千人;
骑兵军(缪拉),5个骑兵师,21,000人;
共计:20个步兵师,11个骑兵师,286门野战炮,176,000人。
调集到各前进港的登陆船只都已全部集中到布伦港,由前线各团第三营组成的一支佯攻部队在布律纳元帅指挥下,留在原有营地以阻遏英军。9月4日,皇帝离开布伦前往马尔梅松。大军团已经开拔。除奥热罗军外,其他各军到9月26日均已抵达莱茵河前线。
这支庞大的军队的饮食供应给后方勤务提出了一个不容忽视的问题。每人出发时仅携带了四天的干粮。此后,各单位就在他们途经之地征收粮秣给养,幸亏这些地方都十分富饶,而且正好秋收刚刚结束。
9月13日,拿破仑还在巴黎,他获悉奥军在10日渡过了因河并已侵入巴伐利亚。其盟友巴伐利亚选帝侯约瑟夫已从慕尼黑撤至维尔茨堡,并在那里与贝尔纳多特军取得了联系。一周后,缪拉报告说,奥军正逼近乌尔姆并沿伊勒河一线构筑工事,该河正好在这个要塞区与多瑙河汇合。这个消息真是好得令人难以置信,因为如在乌尔姆下方越过多瑙河,那么拿破仑就能插入奥军和俄军之间,同时还可以切断他们与维也纳之间最便捷的交通线。他右手的两个军(拉纳和内伊)本来奉命向乌尔姆进军,现又奉命取道斯图加特和路德维希堡向海登海姆和甘德尔芬根(分别位于乌尔姆之北和东北)进军以探明敌军北翼的位置。第一、二、三、四军则继续向东南前进,在因戈尔施塔特和多瑙沃尔特之间渡过多瑙河,然后问慕尼黑和奥格斯堡推进。这样,他们就将横跨奥军主要交通线的两侧并把奥军与即将到达的俄军隔开。
此时大军团正以每天十五英里的速度向莱茵河一线前进,因此拿破仑现在也就有点时间处理诸如海上战略方面的一些事情。9月13日,他写了一篇冗长而又不足以令人相信的备忘录,题为《我创建布伦舰队的目的》。在最终放弃侵英计划之后,他于14日又给维尔纳夫下达了一项新的指示。当时,维尔纳夫指挥着法国的主力舰队,拥有法国和西班牙大型战舰三十二艘,但被英国海军封锁在加的斯。维尔纳夫奉命冲破封锁进入地中海,在卡塔吉纳与另一支西班牙海军中队会合后,驶往那不勒斯,把法国的援军送到那里登陆,尔后再回到土伦整修。这一灾难性的命令结果使维尔纳夫的舰队一个月后被纳尔逊全歼于特拉法加。然而,由于对维尔纳夫已丧失信心,次日他又命令维尔纳夫把指挥权移交给罗西里将军,而罗西里刚到达马德里就听到维尔纳夫全军覆灭的消息[注:维尔纳夫将军很不幸。他在特拉法加海战中被俘,一直到1806年双方交换俘虏时才返回法国,回国后因不堪冷遇而自杀。]。